SnapGene(分子生物学工具)[含安装教程]

SnapGene软件是一款功能强大的分子生物学软件，模拟了Clontech的In-Fusion克隆技术，专为生物学家、遗传学家和分子生物学家设计，只需选择您想要融合的DNA片段，即可设计引物，是创建无缝基因融合的一种非常通用的方法。它提供了直观的界面和全面的功能，帮助用户进行DNA序列分析、基因克隆、引物设计等工作。其强大的序列编辑和可视化能力，以及与其他生物学软件的适应性。

SnapGene特色

1、In-Fusion 克隆
Clontech的In-Fusion克隆技术是创建无缝基因融合的一种非常通用的方法。SnapGene是第一个模拟此程序的软件。只需选择您想要融合的DNA片段，SnapGene即可设计引物。
2、GibsonAssembly
许多研究人员转向吉布森大会，不使用限制性内切酶将片段插入质粒。通过PCR扩增待连接的DNA片段以产生重叠末端。SnapGene简化了吉布森装配反应的计划，并自动化了底漆设计。
3、限制性克隆
SnapGene独特的限制克隆界面以干净的布局显示您需要的信息。规划克隆程序从未如此简单。如果你已经知道你想要做什么，克隆模拟只需要几秒钟。如果克隆程序存在设计缺陷，则可以在模拟过程中捕获并纠正错误。
4、PCR＆诱变
设计引物后，可用它们来模拟常规PCR，重叠延伸PCR或诱变。产生的DNA序列文件立即可用于进一步操作。与限制性克隆界面一样，针对引物的界面以直观的方式显示关键信息。
5、自动文档
SnapGene最令人惊奇的地方在于它会自动记录克隆项目中的步骤。每次编辑序列或模拟克隆或PCR或诱变时，该程序都会自动记录在图形历史记录中。在模拟DNA构建体的创建之后，您可以将历史记录用作实验方案。嵌入在最终文件中的是所有的祖先构造，其中的每一个都可以作为单独的文件复活。

安装教程

1、在本站下载并解压，双击SnapGene.exe运行，选择安装路径，点击next，如图：

2、许可协议，点击i agree，如图：

3、现在安装附件，用户可以根据需求安装；

4、安装完成，点击finish即可。

SnapGene亮点

1.直观易用的界面，降低学习成本。
2.强大的序列分析功能，深入挖掘数据。
3.实时预览和编辑效果，提高工作效率。
4.与主流生物学软件无缝集成。
5.丰富的在线资源和社区支持。
6.支持批量处理和自动化操作。
7.高度可定制化，满足个性化需求。
8.定期更新，保持软件的先进性。
9.提供专业的技术支持和培训。
10.适用于各种生物学研究领域。

使用教程

限制性克隆的技巧
对于许多应用，常规限制性克隆仍然是最好的方法。一些简单的技巧将有助于确保您的克隆顺利进行。
1、一般技巧
首先，在程序的每一步都要小心。从长远来看，这种方法可以节省时间。
确保DNA非常干净。当制备载体或切除待插入的片段时，从约2μg的DNA开始。
每次酶促反应后，用旋转柱纯化DNA。在40-45μl的10mM Tris（pH8.5）中洗脱DNA，然后进行下一步反应。（在用凝胶纯化DNA片段之前不需要使用旋转柱。）
为了最大限度地提高效率，请尽量减少程序中的步骤数。例如，将钝端片段克隆到钝性载体位点（例如SmaI位点）比将其用Klenow或T4 DNA聚合酶钝化的位点更好。
如有疑问，用凝胶纯化DNA片段。更清洁的起始材料将产生更好的结果。
2、准备矢量
限制性克隆最常见的问题是在手术后恢复起始载体。该问题有两个原因：载体的不完全消化，以及切割载体与其自身的重新连接。下面描述的技巧将最大限度地减少这些影响。
确保载体的消化完成。使用过量的限制酶（约20 U，2μgDNA），消化约4小时。如果载体需要用两种具有不同最佳反应缓冲液的酶切割，则依次进行消化，并在其间进行旋转柱纯化。
消化载体（并且如果合适的话钝化），用磷酸酶处理：在37℃下1小时处于5"突出端，或者如果DNA具有任何平末端或3"突出端则在50℃处理1小时。
用旋转柱除去磷酸酶。通常不需要对载体进行凝胶纯化，因为磷酸酶处理会使产生的任何额外DNA片段失活。
3、使用载体，确保消化和磷酸酶反应完成。彻底和反复地涡旋混合物，并且不允许任何液滴逃脱酶处理。在涡旋后短暂旋转以确保管侧没有留下液滴是个好主意。
准备插入的片段
为了制备插入的片段，不完全消化不是一个严重的问题，因为片段的部分回收是可接受的。您可以使用相对较短的消化时间，对于双重消化，您可以使用对一种或两种酶来说不是最理想的反应缓冲液。
用凝胶纯化插入的片段。除去除不需要的或不完全消化的DNA外，该方法还可去除酶和小分子。当用透照仪观察DNA条带时，不要使用312nm或更低的短波紫外线，因为DNA会受到严重损害。请改用360-365 nm紫外灯。
如果通过PCR产生插入的片段，则在进行任何限制性消化之前用凝胶或旋转柱纯化。如果您计划将平末端PCR片段（用聚合酶如Pfu产生）克隆到磷酸酶处理的载体中，请确保您的PCR引物含有5"-磷酸。
结扎和转化
使用磷酸酶处理的载体，进行对照连接，其中省略插入的片段。该对照连接应该产生非常少的转化体，因为只有环状DNA分子有效地转化大肠杆菌，并且在不与磷酸化片段连接的情况下不能发生载体的再环化。
如果DNA仅有粘性末端，则在室温下连接约1小时。如果DNA具有任何平端，则在室温下连接约4小时并使用高浓度T4连接酶。
微量制作和诊断摘要
如果您使用插入的片段获得了比用于对照连接的结扎更多的转化体，那么您的克隆几乎肯定会起作用，并且您通常只能制作3-4个小量制备物。
在执行小量制备的诊断限制摘要时，始终包括起始向量作为参考标准。

SnapGene优势

1.智能引物设计，提高成功率。
2.可视化基因表达和调控网络。
3.支持实时荧光定量PCR数据分析。
4.进行基因分型和突变检测。
5.提供序列比对和注释工具。

SnapGene优点

给学生，博士研究生和技术人员带来的收益
工作中迅速，比较聪明
SnapGene 让您的 DNA 操作便于可视化和仿真模拟，并且在不正确发生之前友情提示。
保持记录轻而易举
SnapGene 中的每一个 DNA 操作都会自动纪录，因而大家可以清晰地看到你所作的操作并查找老祖先构造的编码序列。
随时学习培训
如果你不太熟悉克隆或特定技术性，丰富多彩直观地 SnapGene 页面可帮助大家掌握工作原理。
轻轻松松与世界各地朋友共享数据信息
SnapGene 的 .dna 文档能通过免费体验混合开发 SnapGene Viewer开启，使您可以和同事共享丰富多样的带批注的地图和编码序列。
PI 和实验室管理工具带来的好处
更有效地得到结论
试验室里的工作人员将停止使用有缺陷的克隆程序流程消耗时间，并将在第一时间逐渐得到恰当的结构。
花较少的时长教我们怎样克隆
SnapGene 是一个非常好的学习工具，乃至初学者克隆人会很快懂得如何自身处理问题。

小编总结

SnapGene软件是一款非常实用的分子生物学工具，其包含了序列编辑和标记、酶切位点分析、质粒图谱构建、序列比对等多种功能，由于其非常强大也被称为「分子生物学界的瑞士军刀」。